小学館は3月4日、漫画『堕天作戦』の作者・山本章一氏および漫画アプリ「マンガワン」を巡る問題について、『週刊文春』3月12日号の記事に関する見解を公式サイトで発表した。 声明では、被害女性への謝罪を改めて表明するとともに、「会社ぐるみで関与したとの認識はございません」と組織的な関与を否定した。 3月4日、『週刊文春』は被害女性に対し事件や示談交渉に関して取材したとする記事を公開。 その中で『週刊文春』は、2021年の示談交渉の際に「マンガワン」の担当編集が、小学館の各部署にも情報共有がなされていると発言していたと報道。小学館の組織的な関与について疑惑が持たれていた。